這篇有趣，但別只吃兔子，會 rabbit starvation
【面對致命病毒，澳洲英國法國的兔子，平行演化抵抗】
英國人 1859 年時，將原產於歐洲的穴兔引進澳洲，結果兔兔大爆發，造成生態浩劫。1950 年，澳洲施放「黏液瘤病毒（myxoma virus）」，希望能消滅不受控制的野生族群，一時殺死惹大部分兔兔。🐰🐰
《滅蚊有望？大溪地用細菌消滅蚊子》
https://neanderthaldna.pixnet.net/blog/post/217967964
世界另一邊，1952 年時，法國也對兔兔使用病毒，隔年致命病毒傳入英國，前幾年滅兔效果都類似澳洲；不過就像許多「生物防治」的案例，三個地方的兔兔，幾年後數量都再度復甦。
現在認為，病毒對兔兔的傷殺力之所以不如以往，是由於兔兔演化出對病毒的抵抗力；另一方面，病毒也變弱惹，不再那麼容易殺死宿主，增加自己的存活機率！
經歷病毒的考驗，活下來的兔兔和以前有什麼差別？這個論文，蒐集惹大批樣本，探討病毒肆虐以後，兔兔遺傳上有哪些改變。
論文主要定序兔兔基因組上，會轉錄為蛋白質的基因位置 exome，一共 19293 個基因，以及粒線體，還有 3 段免疫基因 MHC 周圍的區域。取得樣本有：
法國：古兔 29 隻，現代兔 26 隻。
英國：古兔 29 隻，現代兔 25 隻。（包括一件達爾文的標本🐰）
澳洲：古兔 17 隻，現代兔 26 隻。
歷史上，歐洲的穴兔（Oryctolagus cuniculus）原產於西南歐，主要是法國、西班牙一帶，13 世紀引進英格蘭，1859 年後，又從英國被帶到澳洲。
由樣本間的遺傳差異看來，兔兔老家法國的族群，遺傳多樣性最大，而源自英國的澳洲族群，兩者彼此更加接近，符合兔兔的傳播歷史。
《小王子能馴服狐狸嗎？一場歷經近60年的銀狐馴化實驗》
https://neanderthaldna.pixnet.net/blog/post/222468279
黏液瘤病毒，本來感染美洲的棉尾兔（cottontail rabbit），不會殺死宿主，碰到穴兔卻會致死。病毒一開始作用的時候，穴兔死亡率高達 99.8%，造成極為強烈的演化壓力。
3 個地方的兔兔族群，基因組上合計偵測到 193 個 DNA 變異，可能和適應有關；其中 94 個變異，同時在兩地以上出現。有意思的是，絕大部分變異，在各地兔兔碰見病毒以前，族群中就已經有個體配備惹。
由此看來，讓三處兔兔對抗病毒的遺傳變異們，大概早在 800 年前，就已經存在歐洲的族群中。這份潛力後來也被帶到英國與澳洲，等到面對相同病毒的考驗時，又分別脫穎而出。
不過，似乎不存在一個萬能基因，就足以對付病毒。和抵抗病毒有關的 DNA 變異中，只有 1% 能固定在現代族群中，因此，三處兔兔抵抗病毒時，應該都有好幾個基因一同作用。比較明顯的基因有 IFN-ａ21A、CD200-R、CD96、FCRL 等等。
這個研究真是各種啓發～ 🐰
論文：
http://science.sciencemag.org/…/…/2019/02/13/science.aau7285
新聞稿：
https://www.eurekalert.org/pub_re…/2019-02/uoc-drh021219.php
新聞稿：
https://www.eurekalert.org/pub_re…/2019-02/asu-hti021419.php
Science新聞：
http://www.sciencemag.org/…/seventy-years-ago-humans-unleas…
starvation意思 在 [問題] 有關cell starvation - 精華區Biotech 的推薦與評價
我會再paper上面看到做實驗時會先將培養液中的血清移除
請問像這樣starvation的動作是有什麼樣特別的意義嗎
尤其是再血管生成的tube formation的實驗中
我常常會看到需要starvation的情形
請問有人是做這相關的可以告知一下嗎
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大家都說沒有相本的是遜咖
好險我剛好有
https://guest.taipeilink.net/aaa0010u
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◆ From: 211.74.4.111
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作者 HIbaby (嗨北鼻) 看板 Biotech
標題 Re: [問題] 有關cell starvation
時間 Sat Nov 20 09:27:10 2004
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基本上血清裡面可能含有很多你沒有辦法確定的cytokine
當你不移除 可能血清裡面的條件 會影響你的實驗結果
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PTT 統合生命科學研究院
Biotech 生物醫學研究所 幹細胞研究室
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◆ From: 219.1.156.27
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作者 keku (月光下輕舞) 看板 Biotech
標題 Re: [問題] 有關cell starvation
時間 Sat Nov 20 12:56:22 2004
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嗯嗯!
我以前做過蛇毒蛋白引導的鈣離子濃度的real-time量測
就要確實地在starvation下觀察 因為鈣離子是很popular的訊息傳遞物質
許多外在環境的刺激都會影響到濃度升降 所以就直接泡在PBS裡監測了
通常需要用單一stumili誘發某種路徑的訊息傳遞
就必須經過starvation的步驟 以防太多"營養"造成太大的環境變數
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Biotech 生醫工程研究所 超高解析率顯微技術 研究室
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◆ From: 140.109.225.161
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作者 aggaci (五子棋啦) 看板 Biotech
標題 Re: [問題] 有關cell starvation
時間 Sat Nov 20 20:12:35 2004
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※ 引述《ghjkl (消)》之銘言：
: 我會再paper上面看到做實驗時會先將培養液中的血清移除
: 請問像這樣starvation的動作是有什麼樣特別的意義嗎
: 尤其是再血管生成的tube formation的實驗中
: 我常常會看到需要starvation的情形
: 請問有人是做這相關的可以告知一下嗎
細胞週期同步化...
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作者 Lipaty (月餅不要吃太多) 看板 Biotech
標題 Re: [問題] 有關cell starvation
時間 Sun Nov 21 00:08:01 2004
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※ 引述《aggaci (五子棋啦)》之銘言：
: ※ 引述《ghjkl (消)》之銘言：
: : 我會再paper上面看到做實驗時會先將培養液中的血清移除
: : 請問像這樣starvation的動作是有什麼樣特別的意義嗎
: : 尤其是再血管生成的tube formation的實驗中
: : 我常常會看到需要starvation的情形
: : 請問有人是做這相關的可以告知一下嗎
: 細胞週期同步化...
如果是為了要synchronization
那麼只做starvation是不夠的
一般必須視需求 使用double thymudine block
或利用nocodazole之類的藥物
才能達到90%以上的同步化
原po問題的答案應該是如同版友們說的避免干擾
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◆ From: 61.223.30.68
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作者 YuChHa (吃得苦中苦) 看板 Biotech
標題 Re: [問題] 有關cell starvation
時間 Sun Nov 21 00:22:38 2004
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※ 引述《ghjkl (消)》之銘言：
: 我會再paper上面看到做實驗時會先將培養液中的血清移除
: 請問像這樣starvation的動作是有什麼樣特別的意義嗎
: 尤其是再血管生成的tube formation的實驗中
: 我常常會看到需要starvation的情形
: 請問有人是做這相關的可以告知一下嗎
通常starvation的目的是要induce細胞的differentiation
當然避免干擾也是有的!!
抑制cell mitosis
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◆ From: 61.223.132.82
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作者 Lipaty (月餅不要吃太多) 看板 Biotech
標題 Re: [問題] 有關cell starvation
時間 Sun Nov 21 00:47:21 2004
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※ 引述《YuChHa (吃得苦中苦)》之銘言：
: ※ 引述《YuChHa (吃得苦中苦)》之銘言：
: : 通常starvation的目的是要induce細胞的differentiation
: : 當然避免干擾也是有的!!
: 補充ㄧ下 抑制cell mitosis
做有關分化的實驗 starvation才扮演induce分化的角色
angiogenesis是不是分化呢?
顯然不是 所以starvation在這裡 不是為了誘發分化
另外 要抑制mitosis的話 光是starvation不夠的
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◆ From: 61.223.30.68
作者 blence ( ) 看板 Biotech
標題 Re: [問題] 有關cell starvation
時間 Sun Nov 21 00:51:55 2004
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※ 引述《Lipaty (月餅不要吃太多)》之銘言：
: ※ 引述《aggaci (五子棋啦)》之銘言：
: : 細胞週期同步化...
: 如果是為了要synchronization
: 那麼只做starvation是不夠的
: 一般必須視需求 使用double thymudine block
: 或利用nocodazole之類的藥物
: 才能達到90%以上的同步化
: 原po問題的答案應該是如同版友們說的避免干擾
沒錯，為了維持實驗的精確性
許多要拿來處理細胞的物質都需要使用serum-free medium
甚至有些還要求要phenol red free的medium或buffer
這樣才不會干擾實驗結果
這個動作跟synchronization在處理的時間上有很大差異
一般人類細胞在synchronization時
往往需要兩三天以上的serum satrvation
而且synchronize細胞尚且可含0.1%~0.2%serum
但是拿藥物處理細胞時，往往是完全serum-free的
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◆ From: 61.31.144.25
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